全国施設分布図
| 01. | 本郷キャンパス | 本部事務、附属図書館、文書館、法学政治学研究科・法学部、医学系研究科・医学部、医学部附属病院、工学系研究科・工学部、人文社会系研究科・文学部、理学系研究科・理学部、経済学研究科・経済学部、教育学研究科・教育学部、薬学系研究科・薬学部、情報理工学系研究科、情報学環・学際情報学府、公共政策学連携研究部・教育部、東洋文化研究所、社会科学研究所、史料編纂所、総合研究博物館、環境安全研究センター、グローバル教育センター、大学総合教育研究センター、本郷保健センター、素粒子物理国際研究センター、未来ビジョン研究センター、高大接続研究開発センター、相談支援研究開発センター、東京カレッジ、ニューロインテリジェンス国際研究機構等 | |
| 02. | 浅野キャンパス | 工学系研究科・工学部、理学系研究科・理学部、低温科学研究センター、アイソトープ総合センター、情報基盤センター、総合研究博物館タンデム加速器研究棟 | |
| 03. | 弥生キャンパス | 農学生命科学研究科・農学部、農学生命科学研究科附属動物医療センター、地震研究所、定量生命科学研究所、生物生産工学研究センター、アジア生物資源環境研究センター等 | |
| 04. | 小石川地区 | 理学系研究科附属植物園、総合研究博物館小石川分館、農学生命科学研究科附属樹木園 | |
| 05. | 駒場地区キャンパス | 総合文化研究科・教養学部、数理科学研究科、生産技術研究所、先端科学技術研究センター、駒場保健センター、インターナショナル・ロッジ、グローバル教育センター駒場支部等、地球環境データコモンズ | |
| 06. | 中野キャンパス | 教育学部附属中等教育学校 | |
| 07. | 白金台キャンパス | 医科学研究所、同附属病院、新世代感染症センター等 | |
| 08. | 田無地区 | 農学生命科学研究科附属生態調和農学機構、農学生命科学研究科附属演習林田無演習林 | |
| 09. | 三鷹地区 | 理学系研究科附属天文学教育研究センター | |
| 10. | ― | 人文社会系研究科附属北海文化研究常呂実習施設 | |
| 11. | ― | 農学生命科学研究科附属演習林北海道演習林 | |
| 12. | ― | 大気海洋研究所附属国際・地域連携研究センター大槌研究拠点 | |
| 13. | ― | 工学系研究科原子力専攻、物性研究所附属中性子科学研究施設 | |
| 14. | ― | 農学生命科学研究科附属牧場 | |
| 15. | ― | 理学系研究科附属植物園日光分園 | |
| 16. | ― | 工学系研究科附属柿岡教育研究施設 | |
| 17. | ― | 農学生命科学研究科附属演習林秩父演習林 | |
| 18. | ― | シンクロトロン放射光仙台オフィス | |
| 19. | ― | 理学系研究科附属原子核科学研究センター（和光分室） | |
| 20. | 柏キャンパス | 物性研究所、宇宙線研究所、大気海洋研究所、新領域創成科学研究科、空間情報科学研究センター、環境安全研究センター柏支所、柏保健センター、カブリ数物連携宇宙研究機構、生産技術研究所附属大規模実験高度解析推進基盤、柏図書館、文書館（柏分館）、柏地区共通事務センター、グローバル教育センター柏支部、東京大学 丸和 柏FUSIONフィールド等 | |
| 柏IIキャンパス | 情報基盤センター、産学官民連携棟、インターナショナル・ロッジ、新世代感染症センター | ||
| 柏の葉駅前キャンパス | 柏の葉キャンパス駅前サテライト | ||
| 21. | 検見川キャンパス | 検見川総合運動場・検見川セミナーハウス、薬学系研究科附属薬用植物園 | |
| 22. | ― | 農学生命科学研究科附属演習林千葉演習林 | |
| 23. | ― | 地震研究所附属観測開発研究センター鋸山地殻変動観測所 | |
| 24. | ― | 理学系研究科附属臨海実験所、地震研究所附属観測開発研究センター油壷地殻変動観測所 | |
| 25. | ― | 地震研究所附属観測開発研究センター伊豆大島火山観測所 | |
| 26. | ― | 海洋アライアンス平塚総合海洋実験場 | |
| 27. | ― | 数理科学研究科玉原国際セミナーハウス | |
| 28. | ― | 農学生命科学研究科附属演習林富士瘉しの森研究所 | |
| 29. | ― | 地震研究所附属観測開発研究センター富士川地殻変動観測所 | |
| 30. | ― | 宇宙線研究所附属明野観測所 | |
| 31. | ― | 理学系研究科附属天文学教育研究センター木曽観測所 | |
| 32. | ― | 地震研究所附属観測開発研究センター信越地震観測所 | |
| 33. | ― | 地震研究所附属観測開発研究センター浅間火山観測所 | |
| 34. | ― | 地震研究所附属観測開発研究センター小諸地震火山観測所 | |
| 35. | ― | 地震研究所附属観測開発研究センター八ヶ岳地球電磁気観測所 | |
| 36. | ― | 宇宙線研究所附属乗鞍観測所、同鈴蘭連絡所 | |
| 37. | ― | 宇宙線研究所附属神岡宇宙素粒子研究施設、宇宙線研究所附属重力波観測研究施設、カブリ数物連携宇宙研究機構神岡分室 | |
| 38. | ― | 農学生命科学研究科附属演習林樹芸研究所 | |
| 39. | ― | 農学生命科学研究科附属水産実験所 | |
| 40. | ― | 戸田寮 | |
| 41. | ― | 山中寮内藤セミナーハウス | |
| 42. | ― | 農学生命科学研究科附属演習林生態水文学研究所 | |
| 43. | ― | 地震研究所附属観測開発研究センター和歌山地震観測所 | |
| 44. | ― | 物性研究所附属極限コヒーレント光科学研究センター軌道放射物性研究施設播磨オフィス | |
| 45. | ― | 地震研究所附属観測開発研究センター広島地震観測所 | |
| 46. | ― | 地震研究所附属観測開発研究センター霧島火山観測所 | |
| 47. | ― | 地震研究所附属観測開発研究センター室戸地殻変動観測所 | |
| 48. | ― | 医科学研究所附属奄美医科学研究施設 | |
